Direkt nach ihrer offiziellen Vorstellung sorgte die Nominierung jedoch für politischen Streit. Aigner will sich nicht bei der AfD-Fraktion im Bundestag präsentieren. Auslöser ist ein Kommentar der AfD-Politikerin Beatrix von Storch, die Aigners Nominierung öffentlich als "Armutszeugnis" bezeichnet hatte. Laut Aigners Stabschef Eric Markuse erübrigt sich damit ein Besuch bei der AfD-Fraktion.
AfD-Chefin Alice Weidel kritisierte diese Absage gegenüber dem Portal "The Pioneer" scharf und warf Aigner mangelnde Überparteilichkeit vor. Auch ein Treffen mit der Linken steht vorerst nicht an – die Partei hat Aigner nach eigenen Angaben bisher nicht eingeladen.
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